Bei mir ist das passiert, weil Windows die Energieverwaltung ändert, solange Hyper-V aktiv ist. Schau mal in den installierten Features in der Systemsteuerung
Windiws Vista+ fängt auch gerne mal eine Defragmenteierung an. Verhindern kannst du es eigentlich nur durch strenge Standbyregeln. Muss ja bei wenigen minuten nicht glecih ruhezustand sein, sondern nur platte/monitor aus. oder halt nen samften Standby im RAM.