Ich hätte kein schlechtes Gewissen bei nem Case Mod, die Geräte sind in großer Menge entsorgt worden, da sollen sich vorher alljene grämen die das Gehäuse einfach verschrottet haben. Wenn man es schön macht/gute Komponenten wie Lüfter und Netzteil verbaut hat man ja auch ein wertiges Endprodukt das sicher mehr Verwendung findet als im Originalzustand. Wenn es was wirklich seltenes wär (was weiß ich, ein IBM AT zB.) würde ich evtl. schon drauf achten, dass ein Rückbau zum Originalzustand möglich ist.
Was ich persönlich machen würde und was ich bei manchen Builds in alten Gehäusen schade finde, wenn die originalen Laufwerke nicht weiterverwendet werden. Ein paar Groschen für die jeweiligen USB-Adaptierungen und schon sind Floppy und CD-ROM auch mit nem neuen Ryzen nutzbar.